宇宙の光を消し去り暗黒に染めるためにナゲキー(泣き声の力)を集めるシャドーゾーン。その動きに対抗するためコメット王国の使者ミュータンが並行世界から探し出した伝説の戦士メルピュア。日々戦いをくり広げる彼女達のすぐ側にはメルピュアを内部から壊滅するためにシャドーゾーンの幹部が潜んでいた。アリアの想い人のサトウ先生(ウプシロン)と、そして４人目のメルピュア・シャララ。仲間も増え順調に見えたが、ついにメルピュア壊滅のために幹部が動き出す。その壊滅へのシナリオは巧妙に仕組まれており、３人はどんどん闇に呑み込まれていく。アビュールの明るさを嫌悪しているシャララはアビュールを毒で侵し破滅へ導き、アリアはサトウ先生に騙され手籠にされ、カペラはアビュールとアリアを助けるため自らを犠牲に差し出す…[BAD END]